Keberhasilan organisasi sangat dipengaruhi oleh kinerja pegawai yang didukung oleh sistem kompensasi, budaya organisasi, dan motivasi kerja yang efektif. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pengaruh kompensasi dan budaya organisasi terhadap kinerja pegawai, pengaruh kompensasi dan budaya organisasi terhadap motivasi kerja, pengaruh motivasi kerja terhadap kinerja pegawai, serta peran motivasi kerja sebagai variabel mediasi pada PT Kimia Farma Apotek Unit Bisnis Purwokerto. Penelitian ini merupakan penelitian kausal dengan pendekatan kuantitatif. Data yang digunakan adalah data primer yang diperoleh melalui penyebaran kuesioner kepada 34 pegawai PT Kimia Farma Apotek Unit Bisnis Purwokerto. Analisis data dilakukan menggunakan Structural Equation Modeling–Partial Least Squares (SEM-PLS). Hasil penelitian menunjukkan bahwa kompensasi berpengaruh positif dan signifikan terhadap kinerja pegawai dan motivasi kerja. Budaya organisasi berpengaruh positif dan signifikan terhadap kinerja pegawai dan motivasi kerja. Motivasi kerja berpengaruh positif dan signifikan terhadap kinerja pegawai. Selain itu, motivasi kerja terbukti mampu memediasi pengaruh kompensasi dan budaya organisasi terhadap kinerja pegawai. Kata Kunci: Kompensasi, Budaya Organisasi, Motivasi Kerja, Kinerja Pegawai.