Peningkatan volume limbah organik dari kulit buah apel (Malus domestica) dan pir (Pyrus communis) merupakan tantangan lingkungan sekaligus peluang untuk menghasilkan produk bernilai tambah melalui fermentasi. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi potensi ecoenzyme hasil fermentasi limbah kulit apel dan pir sebagai agen antibakteri alami terhadap bakteri penyebab jerawat, yaitu Cutibacterium acnes dan Staphylococcus aureus, untuk aplikasi pada produk skincare. Ecoenzyme dibuat melalui fermentasi anaerob dengan perbandingan limbah organik, gula merah, dan air sebesar 3:1:10 selama 90 hari. Karakteristik organoleptik diamati meliputi warna, aroma, tekstur, dan pH, sedangkan kandungan senyawa bioaktif dianalisis menggunakan Gas Chromatography–Mass Spectrometry (GC-MS). Aktivitas antibakteri diuji dengan metode difusi sumuran menggunakan kontrol positif kloramfenikol dan kontrol negatif akuades. Hasil penelitian menunjukkan ecoenzyme berwarna cokelat gelap, beraroma asam segar, bertekstur cair, dan memiliki pH 2,49, yang mengindikasikan fermentasi berlangsung optimal. Analisis GC-MS mengidentifikasi 23 senyawa dengan dominasi asam oleat (36,51%) dan asam heksadekanoat (13,99%) yang dikenal memiliki aktivitas antibakteri, antiinflamasi, dan antioksidan. Uji antibakteri menunjukkan zona hambat rata-rata sebesar 7,15 mm terhadap C. acnes (kategori sedang) dan 11,31 mm terhadap S. aureus (kategori kuat). Temuan ini mengindikasikan bahwa ecoenzyme berbahan limbah kulit apel dan pir berpotensi dikembangkan sebagai bahan aktif alami pada produk skincare anti-acne yang mendukung konsep green cosmetics dan pemanfaatan limbah organik secara berkelanjutan.
Kata kunci: ecoenzyme; kulit apel; kulit pir; antibakteri; bakteri penyebab jerawat.